ابزارها از طريق مجرای ادرار ، مثانه و حالب ، وارد بدن شده سنگ خرد و خارج مى شود. علاوه بر درمان ، پزشکان می توانند به علل ايجاد سنگ كليه و رفع آن پى ببرند. ابزارهای نازک و انعطاف پذیر شامل فيبر لیزر و خارج كننده هاى سنگ از اين طريق وارد سيستم مى شوند. تقریباً تمام مراحل آندوسکوپی به صورت سرپایی قابل انجام است. غیر از درمان سنگ های ادراری، از این روش میتوان در درمان تنگی های مجرا، بزرگی پروستات و سرطان سطحی مثانه نیز استفاده نمود.
در جراحی لاپاروسکوپی ، جراح چندین برش کوچک ایجاد می کند. معمولاً هرکدام بیش از نیم اینچ طول ندارند. ( گاهاً به اين روش جراحى از طريق سوراخ كليد هم گفته ميشود) از هر سوراخ لوله ای وارد شكم شده و جراح با وارد كردن دوربين و ابزار جراحى از اين لوله ها عمل خود را انجام ميدهد.
جراحی روباتیک معمولاً با آسيب كم همراه است. سیستم جراحی روباتیک بالینی شامل بازوی دوربین و بازوهای مکانیکی و ابزار جراحی است که به آنها وصل شده است. جراح بازوها را با نشستن در کنسول رایانه در نزدیکی تخت عمل کنترل می کند. این كنسول از جراحى تصويرى دقيق، بزرگ و 3 بعدی می دهد. جراح اصلى اعضای دیگر تیم را در طول عمل جراحى مديريت می کند.
روشهاى آندوسكوپيك و حداقل تهاجمى در اكثر مواقع به دليل داشتن عوارض كمتر ارجحيت دارد ولى براى داشتن ديد وسيعتر و تسلط بيشتر در بعضى مواقع يا در صورت سابقه عمل جراحى شكمى، جراحى باز جايگاه ويژه اى دارد.